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三轮，小组赛参赛球队恢复为32支，均分成8组进行第一阶段小组赛，各小组前两名共16队进入第二阶段的小组赛，第三名进入欧洲联盟杯（欧洲足联欧洲联赛前身，下面简称：欧联）第三轮；第二阶段小组赛分为4组，各小组前两名共8支球队晋级淘汰九十分钟足球网赛。2003/04赛季起，取消第二阶段小组赛，第一阶段小组赛各小组两名共16队直接进行淘汰赛。2009/10赛季起，外围赛由3轮资格赛和1轮附加赛组成。2012/13赛季起

在2009/10年赛季改制以前，欧足联规定凡有俱乐部连续三届或总共五届赢得冠军后，将可以永久保留奖杯；但现时修例后，奖杯归欧足联永久保留。每届冠军得主可获得一个复制版奖杯。 赢得过5次（及以上）冠军或者曾连续获得三届冠军的球队，可在球衣九十分钟足球网上使用欧联冠军荣誉臂章；臂章上的数字对应的就是该俱乐部获得过的欧联冠军次数；现在只有7次夺冠的塞维利亚足球俱乐部允许在球衣上使用荣誉臂章。

九十分钟足球网英超联赛第一个天空电视台转播协议是5个赛季共1.91亿英镑；第二个转播合同从1997/98赛季开始，共4个赛季，转播费上升至6.7亿英镑；第三个合同为11亿英镑，时间从2001年8月起，共三个赛季。